奇经八脉总说八脉阴维脉阳维脉二维为病阴跷脉阳跷脉二跷为病冲脉冲脉为病任脉任脉为病督脉督脉为病带脉带脉为病气口九道脉释音
序一序二序三总论伤寒热病总论验舌色论验口唇论验二便论辨脉论南北方宜发表不同论南北方宜清里相同论三阴经热病论三阴经寒病论阴症似阳论阳症似阴论宜发表论忌发表论宜清里论忌清里论宜和解论忌和解论宜吐法论忌吐法
重订诊家直诀
序小引揉积论综概晒说跋
序自记第一种一览延龄一卷第二种橘旁杂论上卷古今医书大意不为良相愿为良医为人子者不可不知医方技中医术为要脉四时受病原委六淫相兼说用药如用兵医不尽药石治贵人有四难医家五失七情皆听命于心再论七情总由心发人病
卷上卷下
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
序凡例自记卷一病机赋经论总抄药性歌（凡二百四十首 添加）卷二真中风一中腑中脏类中风二气虚 附血虚。中气痰火湿痰中寒三外因内因暑证四动而得之静而得之湿证五外因内因燥证六风燥火燥虚燥火证七君火相火郁火五志
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
卷上详注灵枢素问伏气化温诸条详注难经伏气发温诸条详注仲景伏气化温证治各条附注仲景暴感暑热证治各条附注仲景兼感湿温证治各条卷中辨正周禹载温热暑疫各条辨正蒋问斋医略伏邪篇辨正张石顽伤寒绪论温热各条辨正吴又