序正文卷（一）独参汤参附汤生脉饮保元汤四君子汤香砂六君子汤当归补血汤佛手散四物汤圣愈汤地骨皮饮犀角地黄汤四生丸当归六黄汤黄建中汤双和饮人参养荣汤归脾汤妙香散天王补心丹酸枣仁汤朱砂安神丸卷（二）补中益气
脉法行经三忌恶阻论胞漏并小产论诸痛论胎逆上逼胀满子悬论诸血症论子肿子气子满论子烦并五心烦热及烦躁口干论子淋论转胞淋闭论子嗽论喘急论泄泻论霍乱论中恶中暑中湿中风论子痫论（一名子冒）痢论疟论伤寒温热时疫论
卷一医经(一)卷二医经（二）卷三医经（三）卷四医经（四）卷五医经（五）卷六医经(六)卷七医经（七）卷八医经（八）卷九本草（一）卷十本草（二）卷十一本草（三）卷十二本草（四）卷十三本草（五）卷十四本草（
序一序二序三序四卷一（礼集）正医法反医法顺医法逆医法内治法外治法完治法碎治法大治法小治法偏治法全治法生治法死治法卷二（乐集）上治法中治法下治法先治法后治法急治法缓治法本治法末治法不内外治法阴治法阳治法
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
魏序林序自序卷一真中风症中风四言脉诀各症方药中风续论类中风症虚痨虚痨续论脉法方治虚痨不治证卷二咳嗽脉法采《圣济》五脏诸咳嗽痰饮喘促实喘方虚喘方脉息哮症惊悸脉息方药血症脉息喻嘉言龙雷之火论卷三遗精诊法赤
叙卷上诊法常以平旦望色常宜定静明堂周身部位明堂六部提纲面貌分应脏腑五官分应五脏五色分应五脏相气十法提纲望法阴阳总纲五色相应提纲五色主病提纲部色主病提纲四时望法相参四时气色主病昼夜阴晴相参五方望法相参气
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
重刻《外台秘要方》序重刻《外台秘要》序《外台秘要》序自序《外台秘要方》序较正唐王焘先生《外台秘要方》序卷第一诸论伤寒八家合一十六首论伤寒日数病源并方二十一首肘后方七首深师方四首短剧方四首集验方五首千金
总论时气（天时一）阴阳（天时二）地利（地利一）基址（地利二）十机（人事一）附∶小产论蓄外家（人事二）药食（论方）饮食（戒饮）男病（疾病一）女病（疾病二）附：衍庆编调经至言辨古续篇大意干道（蓄德一）坤道