序总论论汗麻症干渴发热论论下体冷全身冷论口疮论腹痛论吐痰论唇舌干燥唇舌破裂舌苔论发斑论云暗看疹诸色论论咳嗽论鼻涕鼻衄鼻扇论发搐总附咳嗽诸方论总附渴症诸方论总附鼻涕鼻衄诸方论发水泡论论气促眼闭论（总附白
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
诚求集
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死
林序皇甫序序例卷一精神五脏论第一五脏变第二五脏六腑阴阳表里第三五脏六腑官第四五脏大小六腑应候第五十二原第六十二经水第七四海第八气息周身五十营四时十分漏刻第九营气第十营卫三焦第十一阴阳清浊精气津液血脉第
素灵微蕴序素灵微蕴卷一胎化解脏象解经脉解营卫解脏候解素灵微蕴卷二五色解五声解问法解诊法解医方解素灵微蕴卷三齁喘解吐血解惊悸解悲恐解飧泄解肠澼解脾胃解火逆解素灵微蕴卷四消渴解气鼓解噎膈解反胃解中风解带下
自序例言卷一禀赋源流总论摄养为本总论卷二阴阳脏腑总论卷三营卫经络总论卷四上四诊合参总论卷四下经解格阳关阴脉脉应四时阴阳脉候部位脉象辨病诊脉察色观形经脉应四时十二月五脏绝脉五脏脉象辨脉平病死旺之象辨平病
十二经补泻温凉引经药歌
石药尔雅
卷一用药弊端说卷一各症辩认阴阳用药法眼心病不安肺病咳嗽肺痿肺痈胃病不食脾病呕吐泄泻肝病筋挛肾病腰痛头痛目病耳病肿痛鼻流清涕鼻孔煽动唇口红肿齿牙肿痛口臭[附:口苦、口酸、口辛、口甘、口淡、口糜]舌肿、舌