卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
断死证秘诀秘受不治法受伤治法通用方秘传方附录验方四则
序自序凡例卷一医中百误歌保生四要治阴虚无上妙方人参果医有彻始彻终之理内伤外感致病十九字火字解脉法金针寒热虚实表里阴阳辨医门八法论汗法论和法论下法论消法论吐法论清法论温法论补法伤寒纲领伤寒主治四字论经腑
第1部分第2部分第3部分第4部分
阴阳五行阴阳阳常有余，阴常不足阳化气，阴成形阳气阳强不能密，阴气乃绝阳杀阴藏阳生阴长阳生于阴阳胜则阴病阳损及阴阳中之阳阳中之阴阴不抱阳阴平阳秘阴气阴生于阳阴胜则阳病阴损及阳阴阳阴阳乖戾阴阳互根阴阳离决
原序背疽方总论背疽其源有五察疽发有内外之别审内证用药服补药快捷方式疽发所在有不可治者戒忌麦饭石膏论治疽痈用药大纲论服嘉禾散论服不换金正气散论渴疾本原痈口将收论痈久疮口不合论痈疖不可用膏药贴合论
序上卷正体主治大法扑伤之症治验血脱烦躁血虚发躁气虚血热瘀血泛注瘀血作痛肝火作痛肝火忿怒肝火胁胀肝胆虚症血虚腹痛气虚不溃寒凝不溃脾虚不敛血虚筋挛肾虚气逆湿热乘肝肝经郁火痛伤胃呕药伤胃呕气血不损行气之非下
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
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