叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
自叙凡例卷一中风类中伤风中寒伤寒劳复、食复、女劳复、阴阳易卷二温热病瘟疫大头瘟暑湿消渴火霍乱泄泻伤食不食卷三疟痢疟痢呃逆厥痉疝气冲眩晕卷四虚损痨瘵恶寒发热血证衄血下血溺血汗卷五七情喜怒忧思悲恐惊郁诈病
外科发挥
简介细目上卷下卷
重订产孕集
序（一）自记序（二）重刻外科证治弁言凡例卷一痈疽证治统论痈疽部位名记胃气论论肿论溃论敛论痛论痒五善歌七恶歌饮食宜忌论阳痈证治则例阴疽证治则例烂溃不敛治法翻花起肛治法患孔毒根治法漏管治法多骨治法毒瓦斯攻
《回生集》原叙重刻《回生集》叙卷上内症门吕祖师铁拐杖方无比山药丸萆汤还童酒方老人喘嗽三子养亲汤十子丸种子奇方壮阳种子丸蛔厥心疼急心气疼卒急心疼擦牙乌须不老神方齿衄治牙疼神效方治风火牙疼熏虫牙痛方牙痛噙
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
制药法调经论胎前论胎前诸症胎前门主方加减活法胎前方诀产后产后门主方加减（载后）产后方诀万病回生丹治产后十八症乌金散治产后十八症黑虎丹治产后血症垂死者即生