《仁斋直指》序卷之一总论五脏所主论五脏病证虚实论诸阴诸阳论血营气卫论脉病逆顺论男女气血则一论问病论论《易简方论》附∶原脉论（出《保命集》）附论五篇（出《丹溪心法》）附∶十二经脉歌火湿分治论虚实分治论附
陆序姚序例言卷一卷二卷三附刊书札跋
自序赵序辛序凡例卷之一·杂症脏腑说心包络三焦说五脏配五行八卦说水火说命门说五脏生克说五邪说十二经配三阳三阴说六气说六气后论运气说虚实寒热说补泻论反治论标本说表里论阴阳论夏月伏阴辨气气之病证脉治法血吐血
自叙卷上·经络脏腑无气存亡论躯壳经络脏腑论表里上下论阴阳升降论治病必分经络脏腑论治病不必分经络脏腑论肾藏精论一脏一腑先绝论君火相火论卷上·脉诊脉决死生论症脉轻重论脉症与病相反论卷上·病中风论臌膈论寒热
内外伤辨惑论
辨症玉函
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
凡例上卷小儿初受气论受胎论小儿形证歌颅囟要略择乳母论慎护论护持歌调理五法长寿无病歌寿夭歌杂病证候歌一见生死歌恶症十五候通真子诊脉歌诊脉歌诊脉快捷方式歌五经统论变蒸赋变蒸日例看三关证经诀入门辩症歌相手指
《本草纲目》简介《本草纲目》草部（一）甘草黄芪人参沙参荠苠桔梗长松黄精萎蕤知母肉苁蓉列当赤箭（天麻）术（白术）苍术狗脊贯众巴戟天远志淫羊霍仙茅玄参地榆丹参紫参紫草白头翁白及三七黄连胡黄连黄芩秦艽茈胡（
论治法论伤各要害处不治论用药论各穴要害之处论验轻重伤诀论用药要诀论各伤主方