序卷上十干脏腑配合十二支脏腑经络配合手足经络配天地四时合主表里阴阳脏腑经络病证内外八邪内外病生四类九气五邪五邪微甚十干夫妇配合成五运五运太过不及十二支应六气三阴三阳六气有余不足六气五运应五脏主病六气为
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
序一序二医之可法为问卷之一医学指南总诀二首卷之一本草第一药本五味一首药性指掌九十首妊娠服禁引经药报使六陈十八反(二首并出儒门事亲)十九畏(一首)用药法象(一首)卷之二脉诀第二诊脉入式(一首集次王适斋等
杂症会心录
病机气宜保命集
例言张聿青先生传卷一中风风温卷二湿温温疫说（补）卷三伏暑疟诸寒热霍乱丹痧卷四虚损内伤劳倦卷五咳嗽肺痿肺痈喘卷六吐血衄血蓄血便血溲血卷七痰饮痰湿痰气气郁卷八肝火肝阳肝风眩晕痉厥痰火卷九头痛脘痛胸胁痛腹痛
卷一九针十二原第一（法天）本输第二（法地）小针解第三（法人）邪气脏腑病形第四（法时）卷二根结第五（法音）寿夭刚柔第六（法律）官针第七（法星）本神第八（法风）终始第九（法野）卷三经脉第十经别第十一经水第
《评琴书屋医略》提要自叙凡例序附诗并各题赠卷一外感症春日外感夏日外感秋日外感冬日外感春温症(冬温同论症治)暑症附案(暑邪变疟)湿症泄泻症痢症附论时行传染二症疟症附案(暑邪变疟)又案(疟后辨寒热)卷二消
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽