自序卷一祷告药皇誓疏温证论治人身一小天地论书方宜人共识说卷二日讲杂记《金匮》上工治未病一节辩辨《金匮》之二阳之病发心脾解维脉为病论治张、刘、李、朱后，当以薛、张、吴、喻配为八大家论医宜博览论读《伤寒补
武当淮河派丹丸膏散秘方
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖
素问病机气宜保命集
医医十病
脉学阐微
广嗣五种备要
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
序伤寒论序伤寒卒病论集卷第一辨脉法第一平脉法第二卷第二伤寒例第三辨痉湿暍脉证第四辨太阳病脉证并治法上第五桂枝汤方桂枝二越婢一汤方甘草干姜汤方芍药甘草汤方调胃承气汤方四逆汤方卷第三辨太阳病脉证并治中第六