叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
自序一自序二卷上外症用刀针法火针不可轻用治筋缩法治足筋缩法浮皮兜脓须剪开升药所忌背部湿痰块痔漏疮鸡胸症龟背症虚人有病易昏愦病挟气郁宜审治少壮妇女病要法治孕妇病法时疫捷法（先看两肩有红点）产后治法大略温
黄帝素问宣明论方
序按语八十五条附方
素问上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合论篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九五藏生成篇第十五藏别论篇第十一异法方宜论篇第十二移
孙序徐序沈序卷一华佗论病理神方一○○一·论人法与天地一○○二·论阴阳大要一○○三·论生成一○○四·论阳厥一○○五·论阴厥一○○六·论阴阳痞格一○○七·论寒热一○○八·论虚实大要一○○九·论上下不宁一○
新刻《儒门事亲》序重刊《儒门事亲》序《儒门事亲》后序卷一七方十剂绳墨订一指风痹痿厥近世差玄说二立诸时气解利禁忌式三疟非脾寒及鬼神辩四小儿疮丹瘾疹旧蔽记五证妇人带下赤白错分寒热解六霍乱吐泻死生如反掌说七
房中补益
自叙第一册·诸中门卒中暴厥中风中寒中暑中湿中气中食中恶五绝第一册·诸伤门伤暑伤湿伤燥伤饮食伤劳倦虚劳传尸劳第一册·寒热门发热潮热恶寒往来寒热外热内寒外寒内热上热下寒上寒下热疟厥第二册·诸气门诸气郁痞水
卷上第一章·外疡总论第一节·论阴证阳证第二节·论肿第三节·论痛第四节·论痒第五节·论酸楚不痛第六节·论顽木不痛第七节·论肿疡辨脓之法第八节·论脓之色泽形质第九节·论溃疡之水第十节·论溃疡之血第十一节·