序卷上全论大法第一六经正义第二合并启微第三风寒辨惑第四温暑指归第五湿异同第六平脉准绳第七卷下大阳病解第一阳明病解第二少阳病解第三太阴病解第四少阴病解第五厥阴病解第六制方大法第七
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
兰室秘藏
明堂灸经
简介序卷上卷中卷下附录
刘叙自叙凡例卷一多读书论脉位法天地五行论提纲论因形气以定诊论运气论太素脉论审象论脉有亢制论冲阳太二脉论脉有不可言传论脉无根有两说论调息已定然后诊脉论问情论卷二卷三浮脉（阳）沉脉（阴）迟脉（阴）数脉（阳
卷一 新着脉法心要部位胃脉浮脉沉脉数脉迟脉长脉短脉大脉小脉洪脉微脉实脉虚脉紧脉缓脉芤脉濡脉弦脉弱脉滑脉涩脉动脉伏脉促脉结脉革脉牢脉疾脉细脉代脉散脉奇经八脉冲阳等脉五脏死脉对待比类纲目以脉主病脉真从脉症
卷一安胎论辨胎歌养胎安胎小产卷二恶阻胎痛胎漏跌扑伤胎毒药伤胎胎动满闷子肿子气卷三子悬子烦子痫子淋淋闭溺血遗尿转胞中风中恶眩晕卷四心痛心腹痛小腹痛腰腹背痛子鸣积聚咳嗽霍乱不语泄泻痢疟疾烦渴热病胎蒸吐衄爽
自序卷之一痈疽之源（一）痈疽之别（二）脉法（三）分经络（四）善恶（五）虚实（六）内消（七）内托（八）灸（九）针烙（十）砭镰（十一）敷贴(十二）淋洗（十三）将护（十四）禁忌（十五）肿疡(十六)发表辛凉解
序一序二序三卷一卷二卷三疹痧疹附录吴山散记小引吴山散记