序自序凡例卷一医中百误歌保生四要治阴虚无上妙方人参果医有彻始彻终之理内伤外感致病十九字火字解脉法金针寒热虚实表里阴阳辨医门八法论汗法论和法论下法论消法论吐法论清法论温法论补法伤寒纲领伤寒主治四字论经腑
产育宝庆集
自序卷一医范医鉴慎疾保生慎药求医诊法脉用药卷二古人今人古书今书卷三形体中风伤寒阴证阳证暑暑风霍乱转筋（俗称吊脚痧）热热入心胞疫痧疟三阴疟痢泻疝咳嗽噎吐头痛胁痛腹痛肝病七情不寐卷四吐血诸血汗疸肿消伤食邪
鬼门十三针
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
房中补益
跋白缠喉叙自叙《续重楼玉钥》自叙序总论喉痹大意论喉痹关乎运气而有火湿寒之异统论脾胃皆交于口而脾为之主统论唇为脾胃肝之所主统论舌为心脾所主论齿为肾胃大肠所属诸证补遗附录选方咽喉虚实总辨各证分辨附录医案喉
幼科折衷秘传真本
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
本草乘雅半偈自序本草乘雅义例别录〔衍〕本草乘雅凡例乘雅半偈采录诸书大意第一帙紫芝青芝赤芝黄芝白芝黑芝人参甘草黄蓍实菟丝子莲实茯苓柏实云母丹砂菖蒲赤箭薯蓣干地黄枸杞菊花麦门冬太一余粮石钟乳龙骨蜂蜜第二帙